基本的にはWindows Mobileサンプルプログラムとプロジェクト作成方法は変わりませんが、アプリケーションの種類をDLLにしておきましょう。 シンボルは後で、defファイルを使ってエクスポートするので、チェックはいらないです。
これで、DllMainのみのソースが作成されますので、ここに必要なものを追加していきましょう。